Die
Bundesanstalt für Gewässerkunde (BfG) wurde vom BMBF mit dem Aufbau der organisatorischen und inhaltlichen Struktur der ökologischen Forschung an der Elbe betraut. Im Mai 1994 wurde die "Projektgruppe Elbe-Ökologie" mit Sitz in der BfG, Außenstelle Berlin eingerichtet. In der ersten Phase war es die Hauptaufgabe der Projektgruppe, gemeinsam mit Wissenschaftlern und Entscheidungsträgern auf Bundes- und Landesebene sowie in enger Abstimmung mit der Internationalen Kommission zum Schutz der Elbe (IKSE) die Forschungskonzeption "ökologische Forschung in der Stromlandschaft Elbe (Elbe-Ökologie)" zu erarbeiten. Diese bildet die Grundlage des Forschungsprogramms, das u.a. auf den Ergebnissen und Erfahrungen des BMBF-Verbundforschungsvorhabens "Modellhafte Erarbeitung ökologisch begründeter Sanierungskonzepte für kleine Fließgewässer" aufbaut.