MKOL vypracovává doporučení pro smluvní strany. V delegacích MKOL a pracovních skupinách Komise jsou zastoupeni delegáti z úřadů a vědeckých institucí z České republiky, Německa, Polska, Rakouska a EU. Kromě toho se práce zúčastňují zástupci nevládních organizací.

Zasedání a porada vedoucích delegací smluvních stran a předsedů pracovních skupin se uskutečňují jednou za rok, porady pracovních skupin, jejich podskupin a skupin expertů dvakrát až třikrát ročně.

Pracovními jazyky Komise jsou čeština a němčina.

Osmičlenný sekretariát MKOL podporuje Komisi a její pracovní skupiny po odborné, jazykové a organizačně technické stránce. Sídlo sekretariátu je v Magdeburku.